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No Format |
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#!/bin/bash ###################################################################### #### This section defines options for the pbs batching system ###################################################################### #PBS -m abe #PBS -M YourEmail@griffith.edu.au #PBS -q workq #PBS -l select=1:ncpus=1:mem=2gb,walltime=60:00:00 #PBS -N vivaxIBMS3 # ###Load the pgi compilers. module load compilers/pgi-32bit-12.4 ###Load the R module load R/24.130.03 ##################################################################### #### This section is for my debugging purposes (not required) ###################################################################### echo Running on host `hostname` echo Time is `date` ###################################################################### #### This section is setting up and running your executable or script ###################################################################### cd cd $PBS_O_WORKDIR ###cd /export/home/s12345/pbs/R/ echo Directory is `pwd` source $HOME/.bashrc R CMD BATCH vivaxIBMS3.r resultsIBMS3.Rout '--args a=1 b=c(2,5,6)' test.R test.out #CMD BATCH options which tells it to immediately run an R program #instead of presenting an interactive prompt #R.out is the screen output #results.Rout is the R program output |
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